Untuk dapat menjalankan tugas dan fungsinya yang telah dibebankan, Kantor Departemen Agama Kabupeten Badung memiliki struktur organisasi berdasarkan KMA 373 tahun 2003 termasuk tipologi II-L terdiri dari :
 |
| Stuktur Organisasi Kantor Kementerian Agama Kabupaten Badung |
